研究内容
简介
任何细胞都能对其外界环境的改变作出反应,这是生命现象的基础,而这个信号处理过程是由细胞内的信号网络完成的。
当代生物物理的一个重大挑战就是理解这些信号网络的工作机制。
为迎接这个挑战,我们结合各种实验和理论手段去寻找一些普遍原理,来解释信号网络的不同架构怎么产生复杂的细胞行为。
以细菌行为为例,我们结合各种光学手段(全内反射荧光TIRF、荧光共振能量转移FRET、
激光暗场Laser darkfield、超分辨技术Super-resolution techniques、光镊Optical tweezer)、微流体技术、及分子生物学技术,以及统计物理模型,
从分子马达到信号传导网络水平上研究分子与细胞行为。
我们以细菌趋化(chemotaxis)网络和c-di-GMP网络为例,来研究细胞信号网络。对这两种网络的研究不仅有基础科学上的意义,也有应用前景。
细菌的运动及趋化(chemotaxis)行为是细菌致病的必要条件之一,
对其深入系统的研究有助于开发新的治疗药物。对鞭毛马达的系统研究也有助于将来人造纳米马达的开发和研制。
而c-di-GMP网络参与调节细菌的多种关键生理功能, 包括细胞分化、微生物膜(biofilm)形成、致病因子产生等,对其研究有助于开发新的抗生素。
项目
细菌运动行为及生物马达
鞭毛马达是自然界中纳米技术的一个奇迹。
我们将以高时间和空间分辨率来系统研究鞭毛马达的行为;并且利用鞭毛马达作为趋化(chemotaxis)信号传导系统的输出,
以单细胞精度来研究超长时间下细菌chemotaxis行为。(左下图是高时间和空间分辨的激光暗场装置示意图;右下图是鞭毛马达的切面模型图)
细菌信号传导网络的时间空间动力学性质
以趋化信号传导网络(chemotaxis)和c-di-GMP网络为例,用超分辨手段来研究信号传导网络的空间性质;从输入-输出系统学的角度来研究
信号传导网络的时间动力学性质。(下图是趋化信号网络结构示意图)
不同信号网络的架构在行为上的后果
以趋化信号传导网络为例,研究不同网络架构如何影响网络多个输出端的协同性;以c-di-GMP网络为例,研究不同网络架构如何影响细菌的运动行为。
(下图是c-di-GMP网络结构示意图)
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